花市清真寺是伊斯兰教在北京的四大古寺之一，创建于1415年，占地面积1,797平方米，现存建筑礼拜大殿是寺中最大的建筑，大殿左右墙壁上原有古兰经文，现已剥落无存。

    大殿对面有上渝碑亭一座，原放置雍正皇帝御碑，今碑已移出。寺中还有敬古堂、沐浴室、寻月台和经房、住房等。现除寻月台拆除外，其余建筑均保存完整。寺内现存文物有清康熙二年（1663年）裕亲王书"清真"木匾和乾隆五十二年（1787年）"真一无二"牌匾各1方，悬挂于大殿敞厅两侧壁面。辛亥革命时，宋教仁、蔡元培等经常在这里秘密议事，支持孙中山"五族共和，振兴中华"的思想，揭露袁世凯复辟的阴谋。

    1912年7月7日中国近代规模最大、影响最深的穆斯林进步团体--中国回教俱进会在这里成立，是近代中国穆斯林爱国运动之发祥地。